雄性和雌性麦哲伦企鹅都为保护自己的巢穴而战，但大多数战斗都涉及两名在领地纠纷中争斗的雄性。这些争斗在繁殖地很普遍，多达200,000只的繁殖地密集地拥挤，成对的鸟巢之间可能相距200厘米。当它们准备离开巢穴时，刚孵出的企鹅立即成群活动或成群地进入海洋。成鸟稍后将在海上加入它们的行列，所有的麦哲伦企鹅将一起在寒冷的洋流中向北行驶。

像大多数企鹅一样，麦哲伦企鹅主要是中上层企鹅，专门在广阔的海洋中觅食。它们是迁徙的鸟类，向南移动，在南美的南岸和附近的海洋岛屿上繁殖。在繁殖季节，它们在陆地上生活，因为它们在沙滩或悬崖上筑巢并照顾幼鸟。在繁殖季节结束时，成鸟和亚成鸟年向北迁移，并采取中上层鱼类的生活方式，能够在离岸1000千米处觅食。

麦哲伦企鹅是群居性动物，经常栖息在一些近海的小岛，它们尤其喜爱选择茂密的草丛或灌木丛中坐窝，以躲避鸟类天敌的捕杀。此外，在某些气候较为干燥，植被并不茂盛的地带，如果地质较为松软，麦哲伦企鹅也会挖洞坐窝。它们可直接饮用海水，并通过体腺将海水的盐分排除体外。在捕食上它们没有特殊的偏好，除了猎物严重匮乏的福克兰群岛附近，成年企鹅的捕食会非常规律的每天进行一次，在白天进行，一般潜水不超过50米，少数情况下，也偶尔达到100米的深度。在冬季，它们会扩大捕食范围，向北可达到巴西海域。

麦哲伦企鹅表现出适应气候变化的行为适应能力。如果它们感觉太热，则可以将其脚蹼向上伸出，以增加微风下暴露的表面积。

像大多数鸟类一样，麦哲伦企鹅通过视觉、触觉、听觉和化学刺激感知环境。它们会进行各种发声，并能够区分特定的通话。这样的呼叫包括狂喜的显示呼叫，相互的显示呼叫，争斗呼叫和联系呼叫。在繁殖季节开始时，雄性会欣喜若狂地进行展示，以吸引伴侣并与其他雄性发生争执。这些调用由于与驴的调用相似而被描述为“编队”。在繁殖季节开始时，雄性和雌性在巢穴相遇时以及孵化过程中改变工作职责时，雄性和雌性都使用相互呼唤。与其他雄性的呼唤相比，雌性对伴侣的呼唤反应更为强烈。雌性站起来，环顾四周，有时会回叫。幼鸟还可以区分父母的相互呼唤和另一组父母的相互呼唤。

配对还使用触觉和视觉显示来相互交流，并加强彼此的联系。为了表现出对雌性的兴趣，雄性会绕着潜在的同伴转圈，然后用脚蹼迅速拍打她。一对伴侣会在一起生活很多年，并且经常互相扮相以维持它们的联系。

研究表明，一般而言，企鹅在很大程度上依靠它们的视线来获取食物并在水下航行。考证这些鸟可以看见至少一部分紫外线光谱。对视网膜的研究还表明，它们缺乏感知红色的能力，并且它们非常擅长感知蓝色或绿色光谱。这可能与以下事实有关：在深海中，存在大量的蓝色和绿色，而红色却很少。企鹅的眼睛特别适合水生环境，因为它们与鱼的眼睛具有相似的敏感性。

麦哲伦企鹅是食肉动物。虽然它们的基本饮食主要是中上层鱼类，虾和甲壳类动物。但它们对猎物的特定选择因其居住地而异。居住在北部繁殖地的企鹅，例如在圣洛伦佐（San Lorenzo）、蓬塔克拉拉（Punca Clara）和蓬塔洛贝里亚（Punta Loberia），主要以鳀鱼为食。在蒙特利昂（Monte Leon）和蓬塔杜尼斯（Punta Dungeness）的南部繁殖地，麦哲伦企鹅捕食鱿鱼、鲱鱼和生鱼。它们在狩猎时可以潜水超过76.2米。可直接饮用海水， 通过体腺将海水的盐分排除体外。

麦哲伦企鹅也存在不少的天敌，在海里的主要天敌有大海燕、海狮、海豹和逆戟鲸。雏鸟和卵也会面对一些鸟类天敌，如海鸥和贼鸥。在陆地上有红狐、灰狐、南美大猫和美洲狮会捕食年龄较大的幼鸟、亚成鸟和成鸟。

麦哲伦企鹅主要分布在南美洲的阿根廷、智利和多风暴的、岩石耸立的南美洲南海岸和福克兰群岛（即南大西洋的马尔维纳斯群岛）沿海，也有少量迁入巴西境内。每年9月，麦哲伦企鹅在巴西渡过冬天后就回到阿根廷和智利进行繁殖。

留鸟：阿根廷和智利。

繁殖地：福克兰群岛（马尔维纳斯群岛）。

非繁殖地：巴西、秘鲁和乌拉圭。

游荡：南极洲、澳大利亚、新西兰、南乔治亚岛和南桑威奇群岛。

麦哲伦企鹅分布图

麦哲伦雄企鹅也为雌鸟和巢穴而战。当雄性在雌性产卵之前战斗时，体型较大的雄性通常会获胜。这些优胜者更容易繁殖，因此也会有更多的雏鸟。优胜者的巢穴往往被遮盖得更多，并且不受其他的因素的影响。在产卵后发生争斗时，无论大小如何，获胜者通常是它要保护的巢穴的所有者。

麦哲伦企鹅巢靠近岸边，它们更喜欢在灌木丛下筑巢，但在必要时也可以将巢铺设在洞穴中。它们选择由小颗粒（例如淤泥和粘土）和少量沙子组成的区域。麦哲伦企鹅在密集的繁殖地中繁殖，巢之间的距离可能只有123-253厘米。

成鸟将在9月初到达繁殖地，并在10月下旬产下2枚卵。平均每年繁殖成功率为每窝0.52只雏鸟。雌雄企鹅都会捍卫自己的巢、卵和幼鸟。巢卵不对称地孵化，并且第一个孵化出的雏鸟体型通常更大并且更好地能够从父母那里获得食物。因此，除非食物过多，否则另一只雏鸟通常死于饥饿。卵重124.8克，长7.5厘米。产好卵后，就开始分担孵化职责，最初，每个父母都要进行为期两周的轮班。随着孵化期的发展，父母更频繁地切换。孵化期持续40-42天。

刚孵化出的雏鸟会处于半睡眠状态，这意味着它们弱小、柔软，不动，并且完全依靠父母的食物和温度调节。父母继续交替进行孵化和觅食的工作，而幼鸟则是通过反流喂养。育雏期持续24-29天后，父母会花费较长的时间进行觅食，并且每隔1至3天就会回到巢中。小企鹅在孵化出 一个月以后，已经长出了部分羽毛，此时它们已经可以偶尔到窝外活动。在这个阶段，它们的样貌和成年企鹅有显著不同，身体上部为棕灰色下部为乳白色，但此时它们一般仅在窝附近的草丛中活动，以很好的躲避天敌并抵御严寒，因此它们不能像帝企鹅等很多其他很多企鹅一样形成由很多小企鹅聚在一起的托儿所。幼雏年龄为40-70天大时，通常在1月至3月初。幼雏会立马成群结队地或立即下水。而成年雄性则仍在岸上呆几个星期换毛。幼雏企鹅将不再受到父母的照料。成年幼鸟进海后，成年企鹅和新成年的企鹅的混合群体便向北迁移至越冬地。

麦哲伦企鹅幼鸟的繁殖年龄：雌性在四岁达到性成熟，雄性企鹅为五岁，这可能是由于雄性企鹅数量多于雌性企鹅所致，使年轻的雌企鹅比年轻的雄企鹅更容易找到配偶。麦哲伦企鹅在野外的平均寿命为25至30年。

据估计，全球物种数量在110至160万对之间：阿根廷沿海约有90万对，福克兰群岛（马尔维纳斯群岛）至少有100,000对，智利至少有144,000对，最大估计有500,000对（Boersma等。 2013、2015）。物种数量趋势在繁殖地和地区之间有所不同。占全球数量估计70%的阿根廷有66个繁殖地中的43个其趋势表明，下降速度接近但不超过30%。趋势论证：在过去的三代（27年）中，总体数量在中等快速的下降。